大阪大学蛋白質研究所   生体分子認識（タカラバイオ）寄附研究部門   助教

2005年10月 - 2008年9月

生物分子工学研究所   構造解析研究部門   主任研究員

2005年4月 - 2005年9月

生物分子工学研究所   構造解析研究部門   研究員

2001年4月 - 2005年3月

生物分子工学研究所   構造解析研究部門   ポストドクラルフェロー

1999年4月 - 2001年3月

生体分子構造データのグラフによる統一の試み

2013年4月 - 2016年3月

クランプによるレプリソームの制御機構の構造機能相関の研究

2012年4月 - 2016年3月

Crystal structures of human peroxisome proliferator-activated receptor δ ligand-binding domain in complexes with phenylpropanoic acid derivatives and a pyridine carboxylic acid derivative 査読 重要な業績

Oyama T, Takiguchi K, Miyachi H.

Acta Crystallographica Section F-Structural Biology Communications   78 ( 2 )   81 - 87   2022年2月( ISSN：2053-230X )

Family D DNA polymerase interacts with GINS to promote CMG-helicase in the archaeal replisome 査読 重要な業績

Keisuke Oki, Mariko Nagata, Takeshi Yamagami, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Takuji Oyama, Yoshizumi Ishino

Nucleic Acids Research   2021年9月( ISSN：0305-1048 )

Structural basis for anti-non-alcoholic fatty liver disease and diabetic dyslipidemia drug saroglitazar as a PPAR α/γ dual agonist 査読 重要な業績

Honda A, Kamata S, Satta C, Machida Y, Uchii K, Terasawa K, Nemoto A, Oyama T, Ishii I

BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   44 ( 9 )   1210 - 1219   2021年9月( ISSN：0918-6158 )

Crystal structures of the human peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)α ligand-binding domain in complexes with a series of phenylpropanoic acid derivatives generated by a ligand-exchange soaking method 査読 重要な業績

Oyama T, Kamata S, Ishii I, Miyachi H

BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   44 ( 9 )   1202 - 1209   2021年9月( ISSN：0918-6158 )

Preparation of co-crystals of human PPARα-LBD and ligand for high-resolution X-ray crystallography 査読 重要な業績

Kamata S, Oyama T, Ishii I

STAR Protocols   2 ( 1 )   2021年3月( ISSN：2666-1667 )

PPARα Ligand-Binding Domain Structures with Endogenous Fatty Acids and Fibrates 査読 重要な業績

Kamata S, Oyama T, Saito K, Honda A, Yamamoto Y, Suda K, Ishikawa R, Itoh T, Watanabe Y, Shibata T, Uchida K, Suematsu M, Ishii I

iScience   23 ( 11 )   101727   2020年11月( ISSN：2589-0042 )

A crystallization and preliminary X-ray diffraction study of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen (PCNA2) alone and in a complex with a PIP-box peptide from Flap endonuclease 1 査読 重要な業績

Ewa Kowalska, Wojciech Strzalka, Takuji Oyama

Acta Biochimica Polonica   67 ( 1 )   49 - 52   2020年3月( ISSN：0001-527X )

Direct visualization of DNA baton pass between replication factors bound to PCNA 査読 重要な業績

Mayanagi K, Ishino S, Shirai T, Oyama T, Kiyonari S, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y

Scientific Reports   8 ( 1 )   2018年11月( ISSN：2045-2322 )

Atomic structure of an archaeal GAN suggests its dual roles as an exonuclease in DNA repair and a CMG component in DNA replication 査読 重要な業績

T. Oyama,S. Ishino,T. Shirai,T. Yamagami,M. Nagata,H. Ogino,M. Kusunoki,Y. Ishino

Nucleic Acids Research   44 ( 19 )   9505 - 9517   2016年9月( ISSN：0305-1048 )

細胞内の巨大な分子モーター「ダイニン」の構造解析 重要な業績

放射光   29 ( 2 )   2016年4月

Integrated molecular mechanism directing nucleosome reorganization by human FACT 査読 重要な業績

Tsunaka T,Fujiwara Y,Oyama T,Hirose S,Morikawa K

Genes and Development   30 ( 6 )   673 - 686   2016年3月( ISSN：0890-9369 )

Peroxisome proliferator-activated receptor gamma has multiple binding points that accommodate ligands in various conformations: Structurally similar PPARgamma partial agonists bind to PPARgamma LBD in different conformations 査読 重要な業績

Ohashi M,Gamo K,Oyama T,Miyachi H

Bioorg. Med. Chem. Lett.   25 ( 14 )   2758 - 2762   2015年7月( ISSN：0960-894X )

Different structures of the two peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARgamma) ligand-binding domains in homodimeric complex with partial agonist, but not full agonist. 査読 重要な業績

Miyachi H.,Ohashi M.,Oyama T.

Bioorg. Med. Chem. Lett.   25 ( 13 )   2639 - 2644   2015年4月( ISSN：0960-894X )

Modification of Chimeric (2S, 3S)-butanediol dehydrogenase based on structural information 査読 重要な業績

Shimegi T.,Mochizuki K.,Oyama T.,Ohtsuki T.,Kusunoki M.,Ui S.

Protein Pept. Lett.   22 ( 3 )   226 - 233   2015年3月( ISSN：0929-8665 )

Disordered interdomain region of Gins is important for functional tetramer formation to stimulate MCM helicase in Thermoplasma acidophilum 査読 重要な業績

Ogino H.,Ishino S.,Oyama T.,Kohda D.,Ishino Y.

Biosci. Biotechnol. Biochem.   79 ( 3 )   432 - 438   2015年3月( ISSN：0916-8451 )

Structural design and synthesis of arylalkynyl amide-type peroxisome proliferator-Activated Receptor gamma (PPARgamma)-selective antagonists based on the helix12-folding inhibition hypothesis 査読 重要な業績

Ohashi M.,Gamo K.,Tanaka Y.,Waki M.,Beniyama Y.,Matsuno K.,Wada J.,Tenta T.,Eguchi J.,Maskishima M.,Matsuura N.,Oyama T.,Miyachi H.

Eur. J. Med. Chem.   90   53 - 67   2015年1月( ISSN：0223-5234 )

Structure of the entire stalk region of the dynein motor domain 査読 重要な業績

Nishikawa Y.,Oyama T.,Kamiya N.,Kon T.,Toyoshima YY.,Nakamura H.,Kurisu G.

J. Mol. Biol.   426 ( 19 )   3232 - 3245   2014年9月( ISSN：0022-2836 )

Molecular dynamics study-guided identification of cyclic amine structures as novel hydrophobic tail components of hPPARgamma agonists 査読 重要な業績

Tanaka Y.,Gamo K.,Oyama T.,Ohashi M.,Waki M.,Matsuno K.,Matsuura N.,Tokiwa H.,Miyachi H.

Bioorg. Med. Chem.   24 ( 16 )   4001 - 4005   2014年8月( ISSN：0968-0896 )

Purification and characterization of a protease from Isaria cicadae 査読 重要な業績

Takekawa C.,Nakamura K.,Homma H.,Oyama T.

日本きのこ学会誌   22 ( 2 )   74 - 78   2014年7月

Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of domain chimeric L-(2S, 3S)-butanediol dehydrogenase. 査読 重要な業績

Shimegi T.,Oyama T.,Ohtsuki T.,Kurisu G.,Kusunoki M.,Ui S.

Acta Crystallogr. Section F   70 ( 4 )   461 - 463   2014年4月( ISSN：1744-3091 )

Mutational and structural analyses of Caldanaerobius polysaccharolyticus Man5B reveal novel active site residues for family 5 glycoside hydrolases 査読 重要な業績

Oyama T.,Schmitz G.E.,Dodd D.,Han Y.,Burnett A.,Nagasawa N.,Mackie R.I.,Nakamura H.,Morikawa K.,Cann I.K.

PLoS One   8 ( 11 )   e80448   2013年10月( ISSN：1932-6203 )

Crystal structures of copper-depleted and copper-bound fungal pro-tyrosinase: Insights into endogenous cysteine-dependent copper incorporation. 査読 重要な業績

Fujieda N,Yabuta S,Ikeda T,Oyama T,Muraki N,Kurisu G,Itoh S

J. Biol. Chem.   288 ( 30 )   22128 - 22140   2013年6月( ISSN：0021-9258 )

Design and synthesis of a series of alpha-benzyl phenylpropanoic acid-type peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma partial agonists with improved aqueous solubility 査読 重要な業績

Ohashi M,Oyama T,Putranto EW,Waku T,Nobusada H,Takaoka K,Matsuno K,Yashiro M,Morikawa K,Huh NH,Miyachi H

Bioorg. Med. Chem.   21 ( 8 )   2319 - 2332   2013年4月( ISSN：0968-0896 )

Bidirectional fluorescence properties of pyrene-based peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) α/δ dual agonist. 査読 重要な業績

Ban S,Oyama T,Kasuga JI,Ohgane K,Nishio Y,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

Bioorg. Med. Chem.   20 ( 11 )   3460 - 3464   2012年4月( ISSN：0968-0896 )

The 2.8 Å crystal structure of the dynein motor domain. 査読 重要な業績

Kon T,Oyama T,Shimo-Kon R,Imamula K,Shima T,Sutoh K,Kurisu G

Nature   484 ( 7394 )   345 - 350   2012年4月( ISSN：0028-0836 )

CENP-T-W-S-X forms a unique centromeric chromatin structure with a histone-like fold. 査読 重要な業績

Nishino T,Takeuchi K,Gascoigne KE,Suzuki A,Hori T,Oyama T,Morikawa K,Cheeseman IM,Fukagawa T

Cell   148 ( 3 )   487 - 501   2012年2月( ISSN：0092-8674 )

Peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) have multiple binding points that accommodate ligands in various conformations: phenylpropanoic acid-type PPAR ligands bind to PPAR in different conformations, depending on the subtype. 査読 重要な業績

Kuwabara N,Oyama T,Tomioka D,Ohashi M,Yanagisawa J,Shimizu T,Miyachi H

J. Med. Chem.   55 ( 2 )   331 - 341   2012年1月( ISSN：0022-2623 )

Architectures of archaeal GINS complexes, essential DNA replication initiation factors. 査読 重要な業績

Oyama T,Ishino S,Fujino S,Ogino H,Shirai T,Mayanagi K,Saito M,Nagasawa N,Ishino Y,Morikawa K

BMC Biology   9   28 - 28   2011年4月( ISSN：1741-7007 )

Detecting structural similarity of ligand interactions in the lipid metabolic system including enzymes, lipid-binding proteins and nuclear receptors. 査読 重要な業績

Shionyu-Mitsuyama C,Waku T,Shiraki T,Oyama T,Shirai T,Morikawa K.

Protein Eng. Des. Sel.   24 ( 4 )   397 - 403   2011年4月( ISSN：1741-0126 )

Design, synthesis, and structural analysis of phenylpropanoic acid-type PPARγ-selective agonists: discovery of reversed stereochemistry-activity relationship. 査読 重要な業績

Ohashi M,Oyama T,Nakagome I,Satoh M,Nishio Y,Nobusada H,Hirono S,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

J. Med. Chem.   54 ( 1 )   331 - 341   2011年1月( ISSN：0022-2623 )

The nuclear receptor PPARγ individually responds to serotonin- and fatty acid-metabolites. 査読 重要な業績

Waku T,Shiraki T,Oyama T,Maebara K,Nakamori R,Morikawa K

EMBO J.   29 ( 19 )   3395 - 3407   2010年10月( ISSN：0261-4189 )

Structural determinant for switching between the polymerase and exonuclease modes in the PCNA-replicative DNA polymerase complex. 査読 重要な業績

Nishida H,Mayanagi K,Kiyonari S,Sato Y,Oyama T,Ishino Y,Morikawa K

Proc. Natl. Acad. Sci. USA   106 ( 49 )   20693 - 20698   2009年12月

Adaptability and selectivity of human peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) pan agonists revealed from crystal structures. 査読 重要な業績

Oyama T,Toyota K,Waku T,Hirakawa Y,Nagasawa N,Kasuga JI,Hashimoto Y,Miyachi H,Morikawa K

Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr.   65 ( 8 )   786 - 795   2009年8月

PPARδ選択的アゴニストの創製と受容体-リガンド複合体構造情報を踏まえた選択性発現機構解明 査読 重要な業績

Kasuga J,Oyama T,Nakagome I,Aoyama A,Sako K,Makishima M,Hirono S,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

薬学雑誌   129 ( 6 )   709 - 718   2009年6月

Crystal structures of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen 1 and 2 proteins complexed with the human p21 C-terminal segment. 査読 重要な業績

Strzalka W,Oyama T,Tori K,Morikawa K

Protein Sci.   18 ( 5 )   1072 - 1080   2009年5月

Atomic structures and functional implications of the archaeal RecQ-like helicase Hjm. 査読 重要な業績

Oyama T,Oka H,Mayanagi K,Shirai T,Matoba K,Fujikane R,Ishino Y,Morikawa K

BMC Struct. Biol.   9   2 - 2   2009年1月

Structural insight into PPARgamma activation through covalent modification with endogenous fatty acids. 査読 重要な業績

Waku T,Shiraki T,Oyama T,Fujimoto Y,Maebara K,Kamiya N,Jingami H,Morikawa K

J. Mol. Biol.   385 ( 1 )   188 - 199   2009年1月

Atomic structure of mutant PPARgamma LBD complexed with 15d-PGJ2: novel modulation mechanism of PPARgamma/RXRalpha function by covalently bound ligands. 査読 重要な業績

Waku T,Shiraki T,Oyama T,Morikawa K

FEBS Lett.   583 ( 2 )   320 - 324   2009年1月

Determination of the critical amino acids involved in the peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) delta selectivity of phenylpropanoic acid-derived agonists. 査読 重要な業績

Kasuga J,Oyama T,Nakagome I,Makishima M,Hirono S,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

ChemMedChem   3 ( 11 )   1662 - 1666   2008年11月

Structure-based design and synthesis of fluorescent PPARalpha/delta co-agonist and its application as a probe for fluorescent polarization assay of PPARdelta ligands. 査読 重要な業績

Araya Y,Kasuga J,Toyota K,Hirakawa Y,Oyama T,Makishima M,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

Chem. Pharm. Bull. (Tokyo)   56 ( 9 )   1357 - 1359   2008年9月

Improvement of the transactivation activity of phenylpropanoic acid-type peroxisome proliferator-activated receptor pan agonists: effect of introduction of fluorine at the linker part. 査読 重要な業績

Kasuga J,Oyama T,Hirakawa Y,Makishima M,Morikawa K,Hashimoto Y,Miyachi H

Bioorg. Med. Chem. Lett.   18 ( 16 )   4525 - 4528   2008年8月

Structural insights into the PIP2 recognition by syntenin-1 PDZ domain. 査読 重要な業績

Sugi T,Oyama T,Morikawa K,Jingami H

Biochem. Biophys. Res. Commun.   366 ( 2 )   373 - 378   2008年2月

Crystallization and preliminary crystallographic study of DNA polymerase from Pyrococcus furiosus. 査読 重要な業績

Nishida H,Tanabe M,Ishino Y,Oyama T,Morikawa K

Protein Pept. Lett.   14 ( 4 )   403 - 405   2007年5月

Crystal structures of autoinhibitory PDZ domain of Tamalin: implications for metabotropic glutamate receptor trafficking regulation. 査読 重要な業績

Sugi T,Oyama T,Muto T,Nakanishi S,Morikawa K,Jingami H

EMBO J.   26 ( 8 )   2192 - 2205   2007年4月

DNAにクランプをはめ込むしくみ―単粒子解析で見えた生き生きとした姿 査読 重要な業績

鈴木博文,宮田知子,真柳浩太,石野良純,大山拓次,森川耿右

生物物理   46 ( 6 )   345 - 348   2006年12月

開けて、はめて、閉める　―　電子顕微鏡で捉えたDNAクランプはめ込みのメカニズム 重要な業績

宮田知子,鈴木博文,大山拓次,森川耿右

蛋白質核酸酵素   51 ( 2 )   155 - 161   2006年2月

Crystallization and preliminary X-ray analysis of the Pax6 paired domain bound to the Pax6 gene enhancer. 査読 重要な業績

Ito M,Oyama T,Okazaki K,Morikawa K

Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.   61 ( 11 )   1009 - 1012   2005年11月

Open clamp structure in the clamp-loading complex visualized by electron microscopic image analysis. 査読 重要な業績

Miyata T,Suzuki H,Oyama T,Mayanagi K,Ishino Y,Morikawa K

Proc. Natl. Acad. Sci. USA   102 ( 39 )   13795 - 13800   2005年9月

Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the ligand-binding domain of human lectin-like oxidized low-density lipoprotein receptor 1 (LOX-1). 査読 重要な業績

Ishigaki T,Ohki I,Oyama T,Machida S,Morikawa K,Tate S

Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.   61 ( 5 )   524 - 527   2005年5月

Detection of subunit interfacial modifications by tracing the evolution of clamp-loader complex. 査読 重要な業績

Saito M,Oyama T,Shirai T

Protein Eng. Des. Sel.   18 ( 3 )   139 - 145   2005年5月

Crystal structure of human lectin-like, oxidized low-density lipoprotein receptor 1 ligand binding domain and its ligand recognition mode to OxLDL. 査読 重要な業績

Ohki I,Ishigaki T,Oyama T,Matsunaga S,Xie Q,Ohnishi-Kameyama M,Murata T,Tsuchiya D,Machida S,Morikawa K,Tate S

Structure   13 ( 6 )   905 - 917   2005年1月

Domain architectures and characterization of an RNA-binding protein, TLS. 査読 重要な業績

Iko Y,Kodama TS,Kasai N,Oyama T,Morita EH,Muto T,Okumura M,Fujii R,Takumi T,Tate S,Morikawa K

J. Biol. Chem.   279 ( 43 )   44834 - 44840   2004年10月

Structural basis for channelling mechanism of a fatty acid beta-oxidation multienzyme complex. 査読 重要な業績

Ishikawa M,Tsuchiya D,Oyama T,Tsunaka Y,Morikawa K

EMBO J.   23 ( 14 )   2745 - 2754   2004年7月

The clamp-loading complex for processive DNA replication. 査読 重要な業績

Miyata T,Oyama T,Mayanagi K,Ishino S,Ishino Y,Morikawa K

Nat. Struct. Mol. Biol.   11 ( 7 )   632 - 636   2004年7月

Mutational analysis of Pyrococcus furiosus replication factor C based on the three-dimensional structure. 査読 重要な業績

Ishino S,Oyama T,Yuasa M,Morikawa K,Ishino Y

Extremophiles   7 ( 3 )   169 - 175   2003年6月

Crystal structures of beta-amylase from Bacillus cereus var mycoides in complexes with substrate analogs and affinity-labeling reagents. 査読 重要な業績

Oyama T,Miyake H,Kusunoki M,Nitta Y

J. Biochem.   133 ( 4 )   467 - 474   2003年4月

Crystal structure of the RuvA-RuvB complex: a structural basis for the Holliday junction migrating motor machinery. 査読 重要な業績

Yamada K,Miyata T,Tsuchiya D,Oyama T,Fujiwara Y,Ohnishi T,Iwasaki H,Shinagawa H,Ariyoshi M,Mayanagi K,Morikawa K

Mol. Cell   10 ( 3 )   671 - 681   2002年9月

DNA複製初期過程の構造生物学 重要な業績

大山拓次,森川耿右

蛋白質核酸酵素   47 ( 8 Suppl. )   919 - 925   2002年6月

Atomic structure of the clamp loader small subunit from Pyrococcus furiosus. 査読 重要な業績

Oyama T,Ishino Y,Cann IK,Ishino S,Morikawa K

Molecular Cell   8 ( 2 )   455 - 463   2001年8月

Structural and functional studies of MinD ATPase: implications for the molecular recognition of the bacterial cell division apparatus. 査読 重要な業績

Hayashi I,Oyama T,Morikawa K

EMBO J.   20 ( 8 )   1819 - 1828   2001年4月

Three-dimensional electron microscopy of the clamp loader small subunit from Pyrococcus furiosus. 査読 重要な業績

Mayanagi K,Miyata T,Oyama T,Ishino Y,Morikawa K

J. Struct. Biol.   134 ( 1 )   35 - 45   2001年4月

Crystal structure of beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides at 2.2 A resolution. 査読 重要な業績

Oyama T,Kusunoki M,Kishimoto Y,Takasaki Y,Nitta Y

J. Biochem.   125 ( 6 )   1120 - 1130   1999年6月

Crystallization and preliminary X-ray analysis of beta-amylase from Bacillus cereus var. mycoides. 査読 重要な業績

Oyama T,Kusunoki M,Kishimoto Y,Takasaki Y,Nitta Y

Protein Pept. Lett.   5 ( 6 )   349 - 354   1998年12月

Properties of Taka-amylase A with Glu230 or Asp297 of the catalytic residue replaced by the corresponding amine. 査読 重要な業績

Oyama T,Myojin M,Nitta Y,Toda H,Nagashima T,Kitamoto K

Biosci. Biotech. Biochem.   60 ( 8 )   1351 - 1352   1996年10月

生体超分子の精密構造解析

大阪大学蛋白質研究所

2017年04月01日 - 2018年03月31日  代表

DNA複製開始因子―DNA修復酵素複合体のX線結晶構造解析

国立遺伝学研究所

2016年04月01日 - 2017年03月31日  代表

生体超分子の精密構造解析

大阪大学蛋白質研究所

2016年04月01日 - 2017年03月31日  代表

生体超分子の精密構造解析

大阪大学蛋白質研究所

2015年04月01日 - 2016年03月31日  代表

DNA複製開始因子―DNA修復酵素複合体のX線結晶構造解析

国立遺伝学研究所

2015年04月01日 - 2016年03月31日  代表

生体超分子の精密構造解析

大阪大学蛋白質研究所

2014年04月01日 - 2015年03月31日  代表

DNA複製開始因子―DNA修復酵素複合体のX線結晶構造解析

国立遺伝学研究所

2014年04月01日 - 2015年03月31日  代表

DNA複製開始因子―DNA修復酵素複合体のX線結晶構造解析

国立遺伝学研究所

2013年10月01日 - 2014年03月31日  代表

バイオサイエンス研究Ａ

2023年度

バイオサイエンス演習Ａ

2023年度

構造生物学特論 重要な業績

2023年度

国立情報学研究所主催のサイバーシンポジウムで講演

山梨大学  トップページトピックス  山梨大学トピックス  2020年9月

国立情報学研究所サイバーシンポジウム（2020年第16回）での講演

役割：講師

国立情報学研究所  2020年第16回サイバーシンポジウム  国立情報学研究所サイバーシンポジウム  2020年9月

大学における新型コロナウイルス感染症対策の好事例について

文部科学省  HPトピックス  文部科学省ウェブページ  2020年8月

タンパク質：構造が機能を物語る

役割：講師

（株）フロムページ  夢ナビライブ201９東京  東京ビッグサイト  2019年6月

タンパク質：構造が機能を物語る

役割：講師

（株）フロムページ  夢ナビライブ201８名古屋  ポートメッセ名古屋  2018年7月

タンパク質：構造が機能を物語る

役割：講師

（株）フロムページ  夢ナビライブ201８東京  東京ビッグサイト  2018年7月

タンパク質：構造が機能を物語る

役割：講師

（株）フロムページ  夢ナビライブ2017東京  東京ビッグサイト  2017年7月

山梨大学Future seed ライブ

役割：出演

FM FUJI  山梨大学Future seed ライブ  FM FUJI スタジオ  2016年8月

タンパク質：構造が機能を物語る

役割：講師

（株）フロムページ  夢ナビライブ2016東京  東京ビッグサイト  2016年7月