Organization
Graduate Faculty of Interdisciplinary Research Faculty of Life and Environmental Sciences Bioagronomy (Biotechnology) Associate Professor
Title
Associate Professor
Takashi Ishiuchi
Research Projects
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染色体除去･可視化･顕微操作による染色体操作法の確立
2024.1 - 2025.4
上原記念生命科学財団 研究助成金
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive Type of fund：：Donation
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ヒストンH3.3による受精後エピゲノムリプログラミングの意義の解明
2023.12 - 2025.9
公益財団法人内藤記念科学振興財団 内藤記念科学奨励金・研究助成
Grant type：Competitive Type of fund：：Donation
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卵子の恒常性維持およびその破綻に寄与するエピゲノム変化の解明
2023.12 - 2024.12
公益財団法人持田記念医学薬学振興財団 持田記念研究助成金
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多能性の多階層的制御機構の解明
2023.11 - 2026.3
公益財団法人第一三共生命科学研究振興財団
Authorship：Principal investigator
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多能性の多階層制御機構の解明
2023.11 - 2024.11
住友財団 基礎科学研究助成
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive Type of fund：：Donation
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卵子形成・維持に資する遺伝子群の網羅的同定とその分子機能の解明
2023.6 - 2028.3
公益財団法人 武田科学振興財団 ビジョナリーリサーチ助成 （スタート）
Grant type：Competitive Type of fund：：Donation
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全能性プログラムにおけるエピゲノム再編成の理解とその人為的制御
2019.6 - 2024.3
新学術領域研究
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全能性プログラムにおけるエピゲノム再編成の理解とその人為的制御
2019.6 - 2024.3
新学術領域研究
Grant type：Competitive
Papers
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YY1-dependent transcriptional regulation manifests at the morula stage Reviewed
microPublication Biology 2024.1
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Molecular mechanisms underlying totipotency Reviewed
Life Science Alliance 2023.9
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Dynamic nucleosome remodeling mediated by YY1 underlies early mouse development Reviewed
GENES & DEVELOPMENT 2023.8( ISSN：0890-9369 )
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Paternally inherited H3K27me3 affects chromatin accessibility in mouse embryos produced by round spermatid injection Reviewed
DEVELOPMENT 2022.9( ISSN：0950-1991 )
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Histone H3K36me2 and H3K36me3 form a chromatin platform essential for DNMT3A-dependent DNA methylation in mouse oocytes Reviewed
Seiichi Yano, Takashi Ishiuchi, Shusaku Abe, Satoshi H. Namekawa, Gang Huang, Yoshihiro Ogawa & Hiroyuki Sasaki
Nature Communications 13 ( 1 ) 4440 - 4440 2022.8( ISSN：2041-1723 )
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Healthy cloned offspring derived from freeze-dried somatic cells Reviewed
Wakayama S, Ito D, Hayashi E, Ishiuchi T, Wakayama T.
Nature Communications 2022.7
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TFB2M and POLRMT are essential for mammalian mitochondrial DNA replication Reviewed
Teppei Inatomi, Shigeru Matsuda, Takashi Ishiuchi, Yura Do, Masunari Nakayama, Shusaku Abe, Kazutoshi Kasho, Sjoerd Wanrooij, Kazuto Nakada, Kenji Ichiyanagi, Hiroyuki Sasaki, Takehiro Yasukawa, Dongchon Kang
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH 2022.1( ISSN：0167-4889 )
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A histone H3.3K36M mutation in mice causes an imbalance of histone modifications and defects in chondrocyte differentiation Reviewed
Epigenetics 2021.10( ISSN：1559-2294 )
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Reprogramming of the histone H3.3 landscape in the early mouse embryo Reviewed
Takashi Ishiuchi, Shusaku Abe, Kimiko Inoue, Wan Kin Au Yeung, Yuka Miki, Atsuo Ogura, Hiroyuki Sasaki
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 2021.1( ISSN：1545-9993 )
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Zfp281 Shapes the Transcriptome of Trophoblast Stem Cells and Is Essential for Placental Development Reviewed
Cell Reports 2019.5( ISSN：2211-1247 )
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A molecular roadmap for the emergence of early-embryonic-like cells in culture Reviewed
NATURE GENETICS 2018.1( ISSN：1061-4036 )
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CAMSAP3 orients the apical-to-basal polarity of microtubule arrays in epithelial cells Reviewed
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 2016.1( ISSN：0027-8424 )
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Early embryonic-like cells are induced by downregulating replication-dependent chromatin assembly Reviewed
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 2015.9( ISSN：1545-9993 )
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LINEing germ and embryonic stem cells' silencing of retrotransposons Reviewed
GENES & DEVELOPMENT 2014.7( ISSN：0890-9369 )
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Higher chromatin mobility supports totipotency and precedes pluripotency in vivo Reviewed
GENES & DEVELOPMENT 2014.5( ISSN：0890-9369 )
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Towards an understanding of the regulatory mechanisms of totipotency Reviewed
CURRENT OPINION IN GENETICS & DEVELOPMENT 2013.10( ISSN：0959-437X )
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Nectins localize Willin to cell-cell junctions Reviewed
GENES TO CELLS 2012.5( ISSN：1356-9597 )
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Mechanosensitive EPLIN-dependent remodeling of adherens junctions regulates epithelial reshaping Reviewed
JOURNAL OF CELL BIOLOGY 2011.8( ISSN：0021-9525 )
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Willin and Par3 cooperatively regulate epithelial apical constriction through aPKC-mediated ROCK phosphorylation Reviewed
NATURE CELL BIOLOGY 2011.6( ISSN：1465-7392 )
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Mammalian Fat and Dachsous cadherins regulate apical membrane organization in the embryonic cerebral cortex Reviewed
JOURNAL OF CELL BIOLOGY 2009.6
Books and Other Publications
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初期胚における遺伝子発現・転写制御
（ Role： Joint Work）
医学書院 2023.6 （ ISSN:0370-9531 ）
Presentations
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全能性を支えるエピゲノム・転写リプログラミング
全能性プログラム 第５回公開シンポジウム 2023.12
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Nucleosome organization in the early mouse embryos International conference
The International Symposium “Totipotency and Germ Cell Development” 2022.11
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Nucleosome organization in the early mouse embryos International conference
The International Symposium “Totipotency and Germ Cell Development” 2022.11
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受精後発生における転写ダイナミクス
第74回日本細胞生物学会大会 2022.6
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受精後発生における転写ダイナミクス
第74回日本細胞生物学会大会 2022.6
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受精後発生を支えるエピゲノム・転写ネットワーク解明にむけた試み Invited
バイオDX キックオフシンポジウム 2021.12
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マウス初期発生における転写ダイナミクス Invited
2021年度幹細胞研究会 2021.12 新学術領域研究「植物多能性幹細胞」
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受精後発生における転写ダイナミクス
第44回日本分子生物学会年会 2021.12
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マウス初期発生における転写ダイナミクス Invited
2021年度幹細胞研究会 2021.12 新学術領域研究「植物多能性幹細胞」
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受精後発生を支えるエピゲノム・転写ネットワーク解明にむけた試み Invited
バイオDX キックオフシンポジウム 2021.12
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受精後発生における転写ダイナミクス
第44回日本分子生物学会年会 2021.12
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受精卵に秘められる謎を紐解く ―ゲノム、エピゲノム、遺伝子発現制御の観点から― Invited
第52回 発生工学研究センターセミナー 発生工学技術開発・実践特別教育プログラム （山梨大学） 2021.9
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受精卵に秘められる謎を紐解く ―ゲノム、エピゲノム、遺伝子発現制御の観点から― Invited
第52回 発生工学研究センターセミナー 発生工学技術開発・実践特別教育プログラム （山梨大学） 2021.9
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eprogramming of the histone H3.3 landscape in the early mouse embryo International conference
2020.12
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Reprogramming of the histone H3.3 landscape in the early mouse embryo International conference
第43回 日本分子生物学会 2020.12
Awards
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日本エピジェネティクス研究会奨励賞
2021.3 日本エピジェネティクス研究会 哺乳類の初期発生の基盤となるエピゲノム制御機構
石内崇士
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日本エピジェネティクス研究会奨励賞
2021.3 日本エピジェネティクス研究会 哺乳類の初期発生の基盤となるエピゲノム制御機構
石内崇士
Teaching Experience (On-campus)
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Basic Data Analysis in Life Science and Medical Research Major achievement
2023Year
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Advanced Lecture on Biological Data Sciences Major achievement
2023Year
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Seminar in Life and Environmental Sciences
2023Year
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Seminar on Bioscience A
2023Year
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Research on Bioscience A
2023Year
Guidance results
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2023
Type：Ph.D. dissertations guidance
Number of people receiving guidance ：2people
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2023
Type：Master's （Major B course）dissertations guidance
Number of people receiving guidance ：3people
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2023
Type：Undergraduate （Major A course）graduation thesis guidance
Number of people receiving guidance ：3people
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2022
Type：Ph.D. dissertations guidance
Number of people receiving guidance ：1people
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2022
Type：Master's （Major B course）dissertations guidance
Number of people receiving guidance ：1people
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2022
Type：Undergraduate （Major A course）graduation thesis guidance
Number of people receiving guidance ：3people
Review of master's and doctoral thesis
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2023
Examiner classification：Second reader
Master ：2people
Doctoral ：2people
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2022
Examiner classification：Second reader
Master ：3people (Overseas student)：0people
Doctoral ：1people (Overseas student)：0people
Thesis Dr. ：0people (Overseas student)：0people
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2022
Examiner classification：Chief examiner
Master ：1people (Overseas student)：0people
Doctoral ：0people (Overseas student)：0people
Thesis Dr. ：0people (Overseas student)：0people